林学菜鸟R语言点格局分析

林学菜鸟—R语言点格局分析

本人是R语言菜鸟一枚，有不足的地方希望大佬们指教。这段时间忙着写毕业论文，因为论文的一部分内容涉及到树种的分布格局，所以自己鼓捣了一段时间。下面是我用R语言（Rstudio）做的一些工作（下列4图分别是：原始数据；输出结果；K分布格局；G分布格局）：

help("Kest")
# 帮助函数,对搞清楚包、函数的作用及使用方法贼有用
install（spatstat）
安装spatstat包
require(spatstat)
#加载spatstat包
setwd("E:/cycl")
#建立工作环境


cycl<-read.csv("cycl.csv",header=T)
head(cycl)
#数据读取
cycl.ppp<-ppp(cycl$X,cycl$Y,window=owin(xrange=c(0,24.5),yrange=c(0,17.2)))
#该函数创建点模式数据集
cycl.envelope<-envelope(cycl.ppp,fun=Kest,nsim=199)
cycl.envelope<-envelope(cycl.ppp,fun=Gest,nsim=199)
#Monte-Carlo检验(Envelope)；k(r)org(r);nism(迭代次数)

write.csv(cycl.envelope, "cyclenvelope.csv")
# 将envelope()函数计算的结果输出到一个.csv文件里，可以根据输出结果自己作图


plot(cycl.envelope,xlab="尺度Scale (m)",ylab="K值K(r)",main="b",xlim=c(0,6))
# xalb:x轴标题；ylab:y轴标题；main:图标题；xlim(调整x轴范围，即尺度范围)

plot(cycl.envelope,xlab="尺度Scale (m)",ylab="G值G(r)",main="b",xlim=c(0,15))
# xlim(调整x轴范围，即尺度范围)


plot(cycl.ppp)
# # 树种空间分布图
plot(envelope(cycl.ppp,Kest))
# # K分布格局
plot(envelope(cycl.ppp,Gest))
# # G分布格局