mysql - Cron Jobs 執行php程序，但卻無法執行？直接訪問卻可以？

請問一下 我用了一個php程序 然後是利用Cron Jobs去固定時間執行
裡面其中有個程序是INSERT INTO數據到mysql確認是否有執行上述php程序
所以只要是有執行，就會INSERT進去 (所以有沒有成功我會知道)

但是很怪異的是
為什麼用Cron Jobs執行這個php程序時
上述的php程序沒有做到
但是卻有 INSERT數據進mysql？
他完全跳過了某段程序？
我那個程序是備份mysql，然後再某目錄產生.sql檔案，類似這樣：

$filename="".date("Y-m-d-H:i",time())."_auto-backup.sql";
$fp = fopen('sql/auto/'.$filename.'','w');
fputs($fp,$mysql);
fclose($fp);

更怪異的是
我直接key url去直接訪問該php卻是成功的！的確有產生sql檔案.....
但是為什麼用Cron Jobs替我執行卻不行？完全跳過這個程序........

再請問一下....要如何調整Cron Jobs的時間？我現在設定每天執行兩次(每12小時執行一次)，但我的理想是中午12點與凌晨12點，他現在執行時間是下午三點跟凌晨三點....