VS2013 git - 标记为挂起删除的项目

我最近想尝试VS2013和SC的Git工具.一切都很好,直到我做了什么,但不知道是什么...我创建了一个nodejs应用程序并将其推送到github.但是,"main"脚本没有直接进入root repo目录,因此我手动创建了另一个repo,以便能够将其推送到heroku.好吧,之后,另一个分支出现在团队资源管理器中,我的主分支被告知所有文件都处于挂起删除状态.我同步了repo并且很好地推入了github但是我必须手动执行它因为我在VS中出错了.现在repo被推送了,我在Sync时不再有任何错误,但是每个文件仍然有那些待处理的删除状态.

此外,因此,我无法对文件进行任何更改并使用VS推送它,我必须手动推送.

任何的想法 ？(我知道这个问题真的不清楚,但我会尽我所能;))